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转录组-ceRNA芯片

产品一 circRNA芯片

筛选差异表达miRNA,差异miRNA靶基因预测。

 

技术特点

  1. circRNA所有探针设计基于国际主流circRNA数据库信息;
  2. 环状RNA -特异的反向剪接位点探针设计,保证每个探针检测的特异性,避免与母基因之间的冗余影响。

 

芯片介绍


 

 

产品二 ceRNA芯片

一箭三雕,一张芯片同时检测lncRNA、circRNA、mRNA。

 

技术特点

  1. 稳定:芯片采用Agilent eArray平台设计,使用Agilent SurePrint技术合成,探针长60mer,检出率高,技术重复性高于99%;利用芯片碱基互补杂交的方式,能够比测序技术更灵敏、稳定地对表达丰度较低的circRNA、lncRNA进行检测;
  2. 超值:芯片覆盖circRNA、lncRNA、mRNA。一份芯片数据同时提供三个层面的表达信息,circRNA和lncRNA作为典型的内源竞争性RNA,此款芯片可以让您畅游ceRNA调控研究;
  3. 特异性高:环状RNA -特异的反向剪接位点探针设计,保证每个探针检测的特异性,避免与母基因之间的冗余影响。

 

芯片介绍


 

伯豪特色

  1. 成熟的服务平台:稳定而系统的芯片实验全面解决方案,可为客户提供总RNA抽提、样品质检、RNA标记、杂交、洗脱、图像扫描、数据分析。
  2. 多样化的服务内容:提供芯片和测序两种高通量检测技术以及低通量检测技术RT-PCR。
  3. 专业的实验人员:从RNA抽提到芯片杂交均配有专业的实验人员,丰富的芯片操作经验,确保芯片实验顺利完成。
  4. 专业的分析团队:实战经验丰富的分析团队,除能快速完成基础分析外,还能根据客户需求完成个性化分析,提供各类高大上的图表。

 

ceRNA芯片分析流程

 

ceRNA芯片技术参数

 

案例展示

案例一

放射治疗是肝癌治疗的有效手段之一,然而放射性肝纤维化是肝癌放射治疗的常见并发症,制约肝癌放疗效果。放射性肝纤维化的发病机制仍未明晰,有待进一步研究。环状RNA(circular RNA,circRNA)是一类广泛参与多种生物学进程的非编码RNA,在人类多种疾病的发生和发展中发挥重要作用。本研究通过伯豪生物提供的circRNA芯片对正常和接受放疗的肝星状细胞中差异表达的circRNA进行分析,探讨其在放射性肝纤维化发病过程中的作用,并通过生物信息学分析,挖掘出这些差异表达基因的潜在功能和与miRNA的互作网络,为放射性肝纤维化的研究提供新的思路。

 

参考文献

[1] Chen Y, Yuan B, Wu Z, Dong Y, Zhang L, Zeng Z(2017).Microarray profiling of circular RNAs and the potential regulatory role of hsa_circ_0071410 in the activated human hepatic stellate cell induced by irradiation.Gene,2017,629:35-42.

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