转录组-ceRNA芯片
产品一 circRNA芯片
筛选差异表达miRNA,差异miRNA靶基因预测。
技术特点
- circRNA所有探针设计基于国际主流circRNA数据库信息;
- 环状RNA -特异的反向剪接位点探针设计,保证每个探针检测的特异性,避免与母基因之间的冗余影响。
芯片介绍
产品二 ceRNA芯片
一箭三雕,一张芯片同时检测lncRNA、circRNA、mRNA。
技术特点
- 稳定:芯片采用Agilent eArray平台设计,使用Agilent SurePrint技术合成,探针长60mer,检出率高,技术重复性高于99%;利用芯片碱基互补杂交的方式,能够比测序技术更灵敏、稳定地对表达丰度较低的circRNA、lncRNA进行检测;
- 超值:芯片覆盖circRNA、lncRNA、mRNA。一份芯片数据同时提供三个层面的表达信息,circRNA和lncRNA作为典型的内源竞争性RNA,此款芯片可以让您畅游ceRNA调控研究;
- 特异性高:环状RNA -特异的反向剪接位点探针设计,保证每个探针检测的特异性,避免与母基因之间的冗余影响。
芯片介绍
伯豪特色
- 成熟的服务平台:稳定而系统的芯片实验全面解决方案,可为客户提供总RNA抽提、样品质检、RNA标记、杂交、洗脱、图像扫描、数据分析。
- 多样化的服务内容:提供芯片和测序两种高通量检测技术以及低通量检测技术RT-PCR。
- 专业的实验人员:从RNA抽提到芯片杂交均配有专业的实验人员,丰富的芯片操作经验,确保芯片实验顺利完成。
- 专业的分析团队:实战经验丰富的分析团队,除能快速完成基础分析外,还能根据客户需求完成个性化分析,提供各类高大上的图表。
ceRNA芯片分析流程
ceRNA芯片技术参数
案例展示
案例一
放射治疗是肝癌治疗的有效手段之一,然而放射性肝纤维化是肝癌放射治疗的常见并发症,制约肝癌放疗效果。放射性肝纤维化的发病机制仍未明晰,有待进一步研究。环状RNA(circular RNA,circRNA)是一类广泛参与多种生物学进程的非编码RNA,在人类多种疾病的发生和发展中发挥重要作用。本研究通过伯豪生物提供的circRNA芯片对正常和接受放疗的肝星状细胞中差异表达的circRNA进行分析,探讨其在放射性肝纤维化发病过程中的作用,并通过生物信息学分析,挖掘出这些差异表达基因的潜在功能和与miRNA的互作网络,为放射性肝纤维化的研究提供新的思路。
参考文献
[1] Chen Y, Yuan B, Wu Z, Dong Y, Zhang L, Zeng Z(2017).Microarray profiling of circular RNAs and the potential regulatory role of hsa_circ_0071410 in the activated human hepatic stellate cell induced by irradiation.Gene,2017,629:35-42.