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lncRNA芯片_售后支持

??1、lncRNA芯片结果在进行定量验证时,有哪些注意事项?

  lncRNA的定量验证方法与mRNA基本相同,需要特别注意的是对于“exonic_sense”来源的lncRNA,在引物设计时一定要区分开lncRNAmRNA。验证过程中需要注意的事项请详见链接内容点击打开链接

2、如何获得lncRNA的序列信息?

我们的SBC lncRNA芯片是基于主流lncRNA数据库设计的,在芯片结果中我们会列出每个探针对应的lncRNA详细的信息可以直接根据accession号在相应的数据库中进行lncRNA序列信息的查找。由于目前lncRNA的研究还处在初级阶段,很多lncRNA都是预测的,因此随着研究的深入,会发现部分lncRNA并非真的为lncRNA。如果芯片结果里出现某些lncRNA在相应的数据库中查找不到序列信息,那么很有可能该lncRNA已经不被该数据库收录了。


3、lncRNA有哪些研究方向?

    lncRNA研究目前可分为biomarker研究和分子机制研究这两个方向。
  由于lncRNA具有组织特异性,且已有相关研究报道lncRNA在疾病组织和血液中特异性表达,因此,lncRNA是一类理想的疾病研究潜在Biomarker

lncRNA可以与蛋白复合体结合,调控基因的转录;可以影响mRNA的稳定性和翻译;可以作为miRNA”sponge”;可以作为miRNA的前体分子等。从lncRNA的分子作用机制入手,是目前lncRNA研究的热点。


4、如何去研究一个lncRNA的生物学功能?

   目前已知功能的lncRNA很少,根据lncRNA可以调控mRNA的特点,进行lncRNA靶基因预测,通过靶基因的功能间接推测lncRNA的功能。

      lncRNA的靶基因预测分为cis预测与trans预测。Cis预测的原理是找出lncRNA所处染色体位置上下游10 kb范围内的蛋白编码基因。Trans预测先采用blast选出序列上与lncRNA互补的mRNA序列,再利用RNAplex计算两序列之间的互补能量,筛选出可能稳定结合的mRNA

5、lncRNA有哪些不同分类?

  根据lncRNA与编码蛋白基因的关系,可以把lncRNA分为5类:1Sense- overlapping:与mRNA外显子有重叠区,转录方向一致;2Antisense-overlapping:与mRNA外显子有重叠区,转录方向相反;3Bidirectional:与mRNA转录方向相反,转录起始位置距离在1kb内;4IntroniclncRNA完全落编码蛋白基因的内含子中;5lncRNA位于编码蛋白基因的基因间区。









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