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circRNA芯片_售后支持

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1、circRNA定量验证时,引物设计基于哪段序列?

  由于circRNA特殊的环化结构,且与母基因具有相同的序列信息,在设计RT-qPCR引物时,我们建议将上下游引物设计在反向剪切位点的两侧,且产物应包含反向剪切位点,如此能够有效检测circRNA的表达量,避免circRNA母基因的冗余影响。具体详见附件点击打开链接

2、有哪些数据库可用于查询circRNA信息?

有很多在线数据库可供参考,具体可以分为两大类:信息查询数据库和功能研究数据库。

1)信息查询数据库:circBaseCIRCpedia

2)功能研究数据库,可进行ceRNA分析,蛋白编码预测,RNA结合蛋白预测等:circRNADbstarBasedeepBasecirc2TraitscircNetCircular RNA Interactome


3、circRNA有哪些研究方向?

  circRNA研究可分为biomarker研究和分子机制研究两个不同的方向。

   由于circRNA表达稳定、不易降解 、具有组织特异性、疾病特异性等特点,且血液中有丰富的表达, 因此使得circRNA 成为理想的Biomarker

circRNA分子机制的研究与lncRNA类似, circRNA可作为miRNA的海绵吸附体影响miRNA对其下游靶基因的表达调控;circRNA调控母基因的转录等生物学功能。此外,circRNA翻译成蛋白进而调控细胞功能也是一个新的方向。


4、如何预测circRNA的生物学功能?

    circRNA的研究尚处于初级阶段,很多功能还有待于进一步研究,目前对circRNA功能的预测主要有两种方法:(1)通过对circRNA母基因的功能分析来推测circRNA的功能,该功能预测主要基于circRNA调控母基因的原则;(2)通过ceRNA机制分析找到潜在的circRNA-miRNA-mRNA调控网络,以mRNA的功能推测circRNA的潜在生物学功能,该功能预测基于ceRNA机制。




  

 

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