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表达谱芯片_售后支持

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1、芯片结果都需要RT-qPCR定量验证么?定量验证需要注意哪些事项?

  芯片检测是一种高通量的筛选工具,后期需要进行一系列的验证工作,其中RT-qPCR是最常见也是最简便的芯片结果验证方法。通常在拿到芯片结果后,可以按照链接中的方法用RT-qPCR对芯片结果进行验证点击打开链接

2、如何判断芯片结果的好坏?

主要从两个方面来考虑:

一、图象:

       主要看芯片扫描图有无划痕,有无图象缺失,图象是否清晰,背景是否过高,点是否规则,大小是否均一,有无融点,拖尾等  现象,图象均一性如何,是否存在边缘不清晰,阳性及阴性内参的情况等。

二、数据:

1)检出率是否异常;(2)相关系数(重复性如何);(3)变异系数(CV值大小);(4)与qPCR趋势的吻合程度;(5)技术重复中差异基 因的重复程度等。


3、芯片结果里面CV值多大合适?

CV值是标准偏差与平均值之比,用百分数表示,计算公式为:CV = SD/Mean×100%。通过比较两组数据之间的CV值来判断芯片体系是否稳定。在Agilent表达谱芯片实验中,用重复探针点(10次重复)信号的CV值来计算芯片的稳定性和技术的稳定性,不同的芯片这样的探针点从20100个不等。Agilent商品化芯片的CV值合格阈值是低于15%


4、芯片检出率大小有没有什么标准,多大合适?

   芯片检出率没有也不应该有一个统一的标准,因为芯片只是一个检测工具,芯片实验的结果是以数据的形式反映出样本里基因表达的情况,也就是说检出率是样品本身的属性,而不是评价芯片实验质量的指标。即使对于同一个物种,不同材料检出率也不同,比如,人组织的检出率要明显高于细胞。一般来说相同样品的检出率相差不超过±5%




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